Gemäß der Norm IEC 61131-3 werden Bibliotheken mit wiederverwendbaren Funktionen und Funktionsbausteinen unterstützt. Auf Grund der besonderen Anforderungen an die Sicherheit, können in Machine Expert – Safety nur speziell entwickelte, sicherheitsbezogene Bibliotheken (Dateierweiterung *.swl) verwendet werden.
Für die Verwaltung der Bibliotheken (d.h. Einbinden und Löschen) steht im Projektbaum der Ordner 'Bibliotheken' zur Verfügung. Nach dem Einbinden einer Bibliothek können die darin enthaltenen Funktionen und Funktionsbausteine mit dem Editor-Assistenten in den Code eingefügt werden.